Gustave Roussy 癌症中心使用 ImageXpress 宽场高内涵成像系统来评估癌症治疗中的细胞应激机制和死亡机制

“我们仔细筛选市场并测试大多数可用的系统。”

法国巴黎 Gustave Roussy 癌症中心 Kroemer 实验室细胞生物学平台

研究主任:Guido Kroemer

团队负责人:Oliver Kepp

教员:Allan Sauvat、Marion Leduc

ImageXpress Micro XLS 宽场高内涵成像分析系统

MetaXpress 高内涵图像获取和分析软件

挑战

Kroemer 实验室关注细胞应激和死亡的分子机制。癌症治疗期间诱发的细胞应激和死亡模式有深远的治疗意义。他们已推出一种系统搜索方法以确定“决定”优先执行哪一个特殊细胞应激或细胞死亡子程序的分子开关。此外,还可使用系统化方式分析癌细胞死亡形式及其对免疫系统的影响,以开发可提高治疗成功率的策略。

Kroemer 实验室的细胞生物学平台(右图)被用作执行筛选方法的核心,因为它提供全自动细胞生物学工作流程,可实现对大规模化合物和 siRNA 文库的表型筛选。他们使用一组荧光生物传感器细胞来评估所有类型的细胞应激和死亡。

为了实现此尖端研究,该团队需要一个可完全集成至自动化平台的高内涵分析系统,它还需包括化合物管理以及自动化细胞培养功能。

Gustave Roussy 癌症详细信息

解决方案

该团队在选定 ImageXpress® Micro XLS 宽场高内涵分析系统之前已仔细筛选市场并检测了大多数可用的系统。目前该团队中拥有五个 ImageXpress 系统,其中两个可永久集成至其自动平台中,一个可按需移进或移出平台,而余下两个是配备了环境控制功能的独立式系统,使他们能够验证活细胞检测筛选平台和微流控设备的研究结果。

他们选定的配置使他们能够搭配使用多带通滤波器与强大的 LED 光引擎,这使得采集速度变得极快,因为它会尽量减少机械移动。

谈到该平台时,Kepp 说道,“集成 ImageXpress 系统使我们能够创建一个提供高效(由于两个相同构建的机器在平台上并行工作)和可靠性(由于它们会产生冗余)的解决方案”。

在数据采集和分析方面,该团队将 MetaXpress® 高内涵图像采集和分析软件与定制的 R 算法搭配使用。

结果

该团队平台的独特设计实现了极灵活的检测设计和多重化,因为它通过一个工业机械设备将自动化细胞培养和化合物管理与三个全自动高内涵分析系统进行集成。

“我们发现 ImageXpress 系统和 MetaXpress 软件很可靠且易于使用。我们使用 MetaXpress 进行信息存储的 SQL 数据库在 R 中编码了所有必需的数据挖掘工具。这种方法让我们用较少的时间就能将图像转化为条形图,这是之前使用我们的旧成像系统无法做到的”,Kepp 说道。

全基因组筛选的通量是 67 x 384 板,且该平台可在一周内完成一次全基因组筛选。除了 siRNA 筛选外,自动化主要用于筛选不同参数(浓度、时间、组合)的化合物文库。

作为该技术可实现的研究类型的示例,该团队新近展示了反式脂肪会抑制由饱和脂肪酸诱导的自噬(图片)。

 

“ImageXpress 系统和 MetaXpress 软件很可靠且易于使用。”

细胞

参考文献

近期出版物

1) Sauvat A. (2018). 反式脂肪酸可抑制由饱和脂肪酸诱导的自噬。 EBioMedicine. pii: S2352-3964 (18) 30115-4。[Epub ahead of print]。

2) Bezu L. (2018). eIF2α 磷酸化是免疫原性细胞死亡的特征。 细胞死亡和分化。[Epub ahead of print]。

3) Liu P. (2017). 鉴定诱导 HMGB1 释放的药理学制剂。 科学报告,7(1): 14915.

4) Sauvat A. (2017). 荧光共定位的自动分析:应用于线粒体自噬。 酶学方法,588: 219-230。

5) Zhou H. (2016). 溶瘤化合物 LTX-401 靶向高尔基体。 细胞死亡和分化,23 (12): 2031-2041。

 

了解该小组研究的更多信息

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